Difference between revisions of "EyeSeeCam SCI"

From biophysics
Jump to navigation Jump to search
Line 1: Line 1:
 
[[File:EyeSeeCam_SCI2.png|thumb|EyeSeeCam SCI]]
 
[[File:EyeSeeCam_SCI2.png|thumb|EyeSeeCam SCI]]
 
==Description==
 
==Description==
 +
 +
==Matlab programming==
 +
 +
===Matlab interface===
 
%todo
 
%todo
 +
 +
===Converting rotation speed===
 +
<pre>
 +
%maak een coordinaat object met begin coordinaten
 +
mycoordinates_XYZ = coordinates_XYZ(startingGaze);
 +
%initalizeer de loop
 +
newpoint = startingGaze;
 +
%loop door alle rotatie stapjes
 +
for i = (timeRange) %iterate in reversed order
 +
    %creeer een rotatiematrix voor het interval van t tot t+delta_t
 +
    delta_angleX = Vx(i)*delta_t;
 +
    delta_angleY = Vy(i)*delta_t;
 +
    delta_angleZ = Vz(i)*delta_t;
 +
    %maak rotatie matrices
 +
    delta_Rx = Rx(delta_angleX);
 +
    delta_Ry = Ry(delta_angleY);
 +
    delta_Rz = Rz(delta_angleZ);
 +
    %vermenigvuldig de rotatiematrices, volgorde is niet belangrijk als de
 +
    %hoeken klein genoeg zijn.
 +
    delta_R = delta_Rx * delta_Ry * delta_Rz;
 +
    % Combineer de rotaties
 +
    % volgorde R_total * delta_R is rotatie in device coordinaten
 +
   
 +
    R_total = R_total * delta_R;
 +
    %roteer van startpunt met nieuwe totaal matrix
 +
    newpoint = R_total * startingGaze;
 +
    %sla voor iedere iteratie het geroteerde punt op
 +
    mycoordinates_XYZ.add(newpoint);   
 +
end
 +
 +
mycoordinates_RAS = transform_XYZ2RAS(mycoordinates_XYZ, definition_XYZ2RAS_EyeSeeCam_Sci);
 +
mycoordinates_DP  = transform_RAS2DP(mycoordinates_RAS);
 +
 +
</pre>

Revision as of 09:31, 1 May 2024

EyeSeeCam SCI

Description

Matlab programming

Matlab interface

%todo

Converting rotation speed

%maak een coordinaat object met begin coordinaten
mycoordinates_XYZ = coordinates_XYZ(startingGaze);
%initalizeer de loop
newpoint = startingGaze;
%loop door alle rotatie stapjes
for i = (timeRange) %iterate in reversed order
    %creeer een rotatiematrix voor het interval van t tot t+delta_t
    delta_angleX = Vx(i)*delta_t;
    delta_angleY = Vy(i)*delta_t;
    delta_angleZ = Vz(i)*delta_t;
    %maak rotatie matrices
    delta_Rx = Rx(delta_angleX);
    delta_Ry = Ry(delta_angleY);
    delta_Rz = Rz(delta_angleZ);
    %vermenigvuldig de rotatiematrices, volgorde is niet belangrijk als de
    %hoeken klein genoeg zijn.
    delta_R = delta_Rx * delta_Ry * delta_Rz;
    % Combineer de rotaties 
    % volgorde R_total * delta_R is rotatie in device coordinaten
    
    R_total = R_total * delta_R;
    %roteer van startpunt met nieuwe totaal matrix
    newpoint = R_total * startingGaze;
    %sla voor iedere iteratie het geroteerde punt op
    mycoordinates_XYZ.add(newpoint);    
end

mycoordinates_RAS = transform_XYZ2RAS(mycoordinates_XYZ, definition_XYZ2RAS_EyeSeeCam_Sci);
mycoordinates_DP  = transform_RAS2DP(mycoordinates_RAS);